Saint-Genis-Pouilly se compose de deux bourgs (Saint-Genis et Pouilly) et deux hameaux (Pregnin et Flies). Les deux bourgs tendent, vu leur extension croissante, à ne plus former qu'un tandis que les deux hameaux restent encore séparés l'un de l'autre et des deux bourgs. L'altitude de la commune varie de 419 m (à l'extrémité Sud de la commune, au confluent entre l'Allondon et le Nant de l'Ecra) à 502 m (à l'extrémité Nord de la commune, dans le hameau de Flies). La commune se situe à la limite entre la plaine du Léman et les premières pentes du Jura. Les communes limitrophes de Saint-Genis-Pouilly sont: Thoiry, Sergy, Crozet, Prévessin-Moëns et Satigny (Suisse).

Référence : Wikipedia